檀香紫檀为乔木，35年生的树高约25米，胸径57厘米。

　　檀香紫檀的树干通直，很少有大枝桠。树皮深褐色，深裂成长方形薄片。树液流出很快变为深红色。小枝被灰色柔毛。

　　檀香紫檀的小叶一般有3-5片，也有6-7片的，比较少见，椭圆形或卵形，长9-15厘米，先端微凹，基部圆，下面密被细毛；侧脉10对以上，网脉明显。

　　檀香紫檀的花黄色或带黄色条纹。

　　檀香紫檀的果圆形，周围具翅，径3-5厘米。花期11-12月，果期4-5月。